Alle 168 Zimmer sind komfortabel eingerichtet und ausgestattet mit einer zentral gesteuerten Klimaanlage, überwiegend mit einem Balkon oder einer Terrasse, Bad oder Dusche, WC, Föhn, Flatscreen, WLAN, sowie Telefon. Doppelzimmer gibt es in einer Größe von ca. 24 bis 26 m², mit oder ohne Balkon, mit oder ohne Meerblick. Suiten bestehen aus einem kombinierten Wohn-/Schlafzimmer und 1 Schlafzimmer und 2 Bädern auf ca. 72 m² Fläche. Sie haben Meerblick.
Familienzimmer im Family Hotel Lisanj sind ab einer Größe von 28 m² (teilweise ohne Balkon) buchbar bis hin zu einer Größe von 64m² in unterschiedlichen Kategorien. Vom Doppelzimmer mit Etagenbett, über zwei Doppelzimmer mit Verbindungstür, bis hin zu einer Aufteilung in Wohnzimmer, 2 Schlafzimmer und 2 Bäder. Einzelne Zimmertypen sind mit oder ohne Meerblick buchbar.